국내 SARS-CoV-2 오미크론 변이형의 역학적 잠재력 추정

한국과 프랑스 연구진이 중증급성호흡기증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2)의 오미크론 변종(B.1.1.529)에 감염된 개인을 분석해 이 바이러스의 전염병 잠재력과 장기적 전망을 추정했다. 유통중. 그들은 기본 생식 수(에스₀) 이 변형의 경우 평균 일련 기간은 2.22일인 반면 1.90입니다.

이전 한국 연구에서 델타 변이에 대해 보고된 것과 비교할 때 오미크론 변이에 대한 현재 연구에서 관찰한 바에 따르면 오미크론 변이가 더 잘 전파되고 더 빠른 지역사회 확산 가능성이 있음을 나타냅니다.

스테이: 한국의 SARS-CoV-2 오미크론 변이체의 일련 간격 및 베이스라인 재생산 번호. 이미지 크레디트: Orpheus FX / Shutterstock.com

기본 재생 번호 및 일련 간격

에스₀ 이것은 완전히 감수성이 있는 집단, 즉 효과적인 백신이나 통제 수단이 없는 경우에 한 명의 감염자로부터 직접 생성된 새로운 사례의 평균 수를 나타냅니다. 감염원의 전파 가능성을 나타내는 역학조사입니다. 만약 에스₀>1, 전염병이 퍼질 것입니다. 에스₀<1, 전염병이 퍼지지 않을 것입니다.

직렬 간격은 연속 상태 사이의 시간 간격을 나타냅니다. 1차 증례/지시자에서 증상이 시작된 시간부터 2차 증례에서 증상이 시작된 시간까지로 추정됩니다. 좋다 에스₀, 직렬 간격은 감염 ​​통제 전략을 설계하는 데 사용되는 전염병 전파 모델에서 중요한 매개변수 역할을 하는 또 다른 중요한 역학 절차입니다.

연구의 하드 카피가 에 출판되었습니다. medRxiv* 기사는 피어 리뷰의 대상이 됩니다.

한국의 교회(n = 74)와 관련된 실험실에서 확인된 SARS-CoV-2 오미크론 변이형 감염의 전파 시리즈(a) 및 역학 곡선(b).

배경

2021년 11월 말, 세계보건기구(WHO)는 새로운 SARS-CoV-2 B.1.1.529 변종을 우려 변종으로 분류하고 Omicron이라는 이름을 지정했습니다. 델타는 전 세계적으로 널리 퍼진 SARS-CoV-2의 지배적 변종으로 남아 있지만, 새로운 변종 오미크론(B.1.1.529)의 출현은 예상치 못한 돌연변이를 일으킬 수 있는 심각하게 돌연변이된 SARS 단백질에 대한 보고로 인해 공중 보건 당국 사이에서 심각한 우려를 일으키고 있습니다. 결과.

그러나 Delta 변형과 비교하여 Omicron 변형의 전송 가능성은 여전히 ​​불분명합니다. 따라서 연구팀은 새로운 변이형의 역학 전파 능력을 더 자세히 설명하기 위해 현재 오미크론 SARS-CoV-2 변이형(B.1.1.529)의 지역사회 전파를 경험하고 있는 한국에서 현재 연구를 수행했습니다.

연구원들은 무엇을 했습니까?

팀은 일련 간격과 기본 클론 수를 추정하는 것을 목표로 했습니다(에스₀), 그리고 한국에서 오미크론 변종의 지역사회 전파에 참여.

이 연구는 한국의 공중 보건 당국에서 Omicron 변이의 사례에 대해 공개적으로 이용 가능한 데이터를 기반으로 했습니다. 데이터는 2021년 11월 25일부터 한국에서 유입된 사례의 지역사회 전파가 시작된 2021년 12월 16일까지 수집되었습니다.

연령, 의심되는 감염원 및 증상 발병 이력을 포함한 접촉 추적 데이터 및 사례 인구 통계를 수집했습니다. 직렬 구간의 분포는 정규 분포 적합을 통해 추정되었습니다. 계산하기 에스₀, 데이터에서 얻은 직렬 간격 분포를 생성 시간 분포의 대용으로 사용했습니다.

결과

총 131명의 오미크론 관련 사례 중 31%(n = 23) 사례가 SARS-CoV-2 백신 2회 접종을 받았고 COVID-19 돌파를 확인했습니다. 1차 및 2차 사례 모두에 대해 알려진 증상 발병 이력이 있는 18개의 전송 쌍이 확인되었습니다.

SARS-CoV-2 오미크론 변이체의 추정된 서열 간격 분포. 실선은 적절한 정규 분포를 나타냅니다.

중간 연속 기간은 2.22일로 추정되었습니다(95% 신뢰할 수 있는 기간 [CrI], 1.48–2.97), 연속 간격 추정치의 표준 편차는 1.62일(95% CrI, 0.87–2.37)인 것으로 나타났습니다. 그만큼 에스₀한국에서 오미크론 변종 발병의 경우 1.90(95% CrI 1.50–2.43)으로 추정되었습니다.

델타 변이에 대한 이전 한국 연구에서는 평균 순차 간격이 3.3일이고 에스₀1.0이 됩니다. 두 연구를 비교하면 오미크론 변이체가 더 잘 전파되는 것으로 나타났습니다. 따라서 엄격한 COVID-19 통제 조치와 COVID-19 백신 접종은 Omicron 변이체의 지역사회 전파를 줄이기 위한 필수 요소로 남아 있습니다.

결정인자

2021년 12월 초 현재 한국 인구의 80%가 코로나19 백신을 2회 접종받았습니다. 그러나 이번 연구에서는 코로나19 백신이 전염에 미치는 영향을 분석하지 않았다. 따라서 결과는 완전히 취약한 인구에서 발생할 수 있는 정확한 시나리오를 나타내지 않을 수 있으며 제한된 자원을 가진 국가에 일반화할 수 없습니다.

*중요 사항

medRxiv 동료 검토를 거치지 않았으므로 결정적인 것으로 간주되어서는 안 되는 예비 과학 보고서를 게시하거나 임상 실습/건강 관련 행동을 안내하거나 확립된 정보로 취급해서는 안 됩니다.